Триумф России на конкурсе iGEM 2020: эксклюзивное интервью

Boris Paleev написал(а) к All в Nov 20 09:10:18 по местному времени:

Нello All!

https://www.vesti.ru/nauka/article/2489617

24 ноября 2020 13:05 Анатолий Глянцев

Триумф России на конкурсе iGEM 2020: эксклюзивное интервью


Российская команда Moscow, состоящая в основном из студентов МГУ, получила золотую медаль на конкурсе биотехнологий iGEM 2020. Команда представила на суд экспертов проект прибора, определяющего различные генетические варианты вируса гепатита C. Это первая подобная система в России.

Вести.Ru взяли эксклюзивное интервью у участниц команды и амбассадора конкурса. На наши вопросы ответили члены команды Moscow: студентка МГУ им. М. В. Ломоносова Марина Марченко и студентка МГМУ им. Сеченова Анастасия Кислова. Также мы поговорили с и амбассадором конкурса iGEM Максимом Боковым, участником iGEM 2019.

Максим Боков рассказал о целях и особенностях конкурса.

- В чём цель конкурса iGEM?

Максим Боков: одной из целей конкурса является объединение школьников, студентов и аспирантов со всего мира для создания проектов по решению самых актуальных проблем человечества с помощью методов генной инженерии. Вдобавок организаторы хотели собрать сообщество людей, которые публикуют свои результаты для бесплатного и открытого пользования.

Важная особенность конкурса iGEM - это комплексность выполняемых проектов. Уникальность конкурса заключается в том, что люди не только работают в лаборатории и решают задачи бионформатики, но и активно взаимодействуют с потенциальными пользователями разработки, научными экспертами и представителями бизнеса. Также участники проводят образовательные мероприятия и популяризируют науку в целом.

- Каковы итоги конкурса в этом году?

Максим Боков: в этом году в соревновании участвовало 249 команд из более чем 40 стран. Из них 168 команд получили золотые медали, 45 команд получили серебро и 26 - бронзу.

- Что получают победители конкурса?

Максим Боков: помимо медалей и строчки в резюме, участники конкурса получают бесценный опыт и знакомства. Студенты узнают, как организовать проект, как представлять его общественности и коммерциализировать идею. Ребята учатся работать в команде, ставят мини-цели, распределяют ресурсы и ответственность, общаются со СМИ, НИИ, крупными компаниями, бизнесменами и прочими представителями бизнес-сектора. Иногда даже создают полноценный стартап.

- Есть ли примеры успешного внедрения в практику разработок, представленных на конкурс?

Максим Боков: да. За всю историю конкурса около 150 проектов стали полноценными стартапами, выросшие в успешные бизнес-проекты.

Далее на наши вопросы отвечали участницы команды Moscow.

- Расскажите о разработке, представленной вашей командой на конкурс. Каково её назначение, как она работает и в чём ваше ноу-хау?

Анастасия Кислова: в этом году мы работали над НaploSense - детектором на разные генетические варианты вируса гепатита С, которые необходимо определять для назначения оптимальной терапии. Генетические варианты - это мутантные разновидности одного вируса, которые могут обладать разными свойствами и требовать разных подходов к лечению. Особую актуальность проблеме придает существование уникального для территории России генетического варианта RF2k/1b. Зачастую он ошибочно определяется как генотип 1b, что приводит к выбору неверной стратегии лечения. Мы работаем над довольно новым в мировой практике и еще не набравшим обороты методом детекции на основе CRISPR/Cas систем. Часть проекта была сфокусирована на совершенно новом для прикладного научного поля белке CasX.

В конечном итоге мы должны получить небольшой и простой в использовании для обычного медицинского персонала прибор. В него можно будет поместить образец крови и через некоторое время по индикатору на экране понять, заражен ли пациент искомым генетическим вариантом.

Важно, что система детекции на основе CRISPR/Cas при необходимости можно перенастроить на другой вирус.

Марина Марченко: наша команда представила на международном конкурсе iGEM прибор НaploSense. Он представляет собой универсальный детектор на разные генотипы РНК-содержащих вирусов, на примере гепатита C.

Как это работает? Напомню, что гепатит С передаётся через кровь, поэтому для начала нужно сдать кровь в медучреждении. Затем вирус из крови пациента инактивируется при высокой температуре.

Вирус гепатита С хранит наследственную информацию в РНК, а не в ДНК, но для анализа нужна именно ДНК. Поэтому выполняется специальная процедура, которая переписывает генетическую информацию с РНК в ДНК.

Далее в дело вступает белок из семейства Cas, того самого, которое используется для редактирования генов. Этот белок настроен так, чтобы расщеплять только молекулы ДНК с определёнными генами. Эти гены и являются признаком штамма, на который нацелен тест.

Пробу со смесью переносят на тест-полоску, содержащую две зоны связывания. Нерасщеплённые молекулы ДНК прикрепляются к первой зоне, а расщеплённые - ко второй.

Если вирус в крови пациента относится к целевому штамму, то белок семейства Cas расщепит часть его ДНК. В этом случае обе зоны связывания получат свою "добычу", и на тесте окажется две полоски. Если же в пробах нет целевых генов, то ДНК не расщепится, и полоска будет только одна. Более подробно о работе детектора можно прочитать на официальном сайте нашей команды.

В случае гепатита С очень важно определить, каким именно генетическим вариантом заразился человек. От этого зависит оптимальная стратегия лечения заболевания, способного привести к циррозу или даже раку печени.

К сожалению, универсальной, быстрой и точной системы детекции на штаммы вирусов на сегодня не существует. Именно поэтому наша команда решила разработать НaploSense. Ведь прибор сможет ускорить постановку диагноза и поможет подобрать оптимальное лечение в разы быстрее, чем это происходит сейчас.

Также, если потребуется, детектор можно будет настроить на детекцию других РНК-содержащих вирусов, таких как SARS-CoV 2 или ВИЧ.

- Какой вы видите дальнейшую судьбу разработки? Есть ли планы по её внедрению, конкретные шаги в этом направлении?

Марина Марченко: мы надеемся, что наша разработка принесёт пользу обществу, и её будут использовать, чтобы помочь бороться с гепатитом С и, возможно, другими вирусными заболеваниями.

В этом году мы полностью проработали теоретическую часть проекта: работу в области биоинформатики, дизайн проекта и макет прибора. В лаборатории же не было доступа из-за пандемии COVID-19. Нам нужно вернуться в лабораторию. Мы планируем протестировать и валидировать прототип нашей системы. Если прототип будет работать согласно расчётам и не менее эффективно, чем существующие аналоги, то нам нужно будет заранее позаботиться о патентовании и зарегистрировать нашу тест-систему.

Так как раньше нам никогда не приходилось иметь дело с реализацией такого крупного проекта, мы обратились к экспертам компании "Биокад" по вопросам патентования и маркетинга.

Если всё получится, то НaploSense станет первым в России детектором генетических разновидностей вирусов, основанным на технологии CRISPR/Cas.

Анастасия Кислова: в ходе проработки проекта мы тесно взаимодействовали с экспертами крупной биотехнологической компании "Биокад". Они провели для нас серию семинаров по маркетингу и внедрению продукта на рынок. Но нужно понимать, что проект начался совсем недавно, и прежде чем думать об открытии стартапа, нужно проделать ещё очень много работы.

- Расскажите о своей команде. Сколько в ней человек, в каких вузах и на каких факультетах они обучаются? Есть ли планы по дальнейшему сотрудничеству между собой?

Анастасия Кислова: в итоговом составе 15 человек. Так как формировалась она на базе биологического факультета МГУ, то ядро составили именно его студенты. Но всё же команда получилась скорее сборной. В её составе есть также ребята и из Сколтеха, и из Тяньцзиньского университета в Китае. Сама я из МГМУ им. Сеченова. Более того, не все из нас студенты: одна из участниц - одиннадцатиклассница, другая, напротив, уже аспирантка.

Однажды собравшись над проектом, члены команды оказываются уже довольно прочно связаны друг с другом общими знакомствами и социальными сетями. Нам как минимум нужно вместе продолжить проработку нашего проекта. Также мы планируем заниматься развитием iGEM-сообщества в России. Это поможет создать удобную стартовую площадку для новых, только собирающихся команд, а также поспособствовать дальнейшей популяризации биоинженерии. Кстати, львиная доля работы команды в этом году пришлась на проведение образовательных и просветительских мероприятий.

Приведёт ли опыт совместного ведения проекта в дальнейшем к новым научным коллаборациям или совместным стартапам, покажет лишь время.

Марина Марченко: официально в составе команды iGEM Moscow 15 участников. В основном это студенты старших курсов биологического факультета МГУ, но также есть студенты Сеченовского и Тяньцзиньского университетов, а кроме того ученица школы №1517.

Также у команды также есть инструкторы - участники конкурса iGEM 2019 года. Руководителями команды являются Алексей Константинович Шайтан, ведущий научный сотрудник кафедры биоинженерии МГУ, кандидат физико-математических наук, и Дмитрий Сергеевич Карпов, старший научный сотрудник Института молекулярной биологии им. В. А. Энгельгардта РАН, кандидат биологических наук.

Конкурс iGEM закончился, но перед нами стоит ещё множество задач. Нужно вернуться в лабораторию и выполнить запланированные эксперименты с детектором. Кроме того, нужно собрать команду на следующий год, рассказать ребятам про структуру iGEM и помочь новым командам из России с участием в конкурсе iGEM.


- Каковы ваши личные впечатления от участия в конкурсе?

Марина Марченко: конкурс iGEM стал для меня уникальным опытом, потому что позволил выйти за пределы научной лаборатории. Необходимо было общаться с экспертами, компаниями, спонсорами, писать тексты для медиаресурсов, рассказывать о нашем проекте и iGEM на лекциях, мастер-классах, фестивалях. В том числе мы участвовали в таких значимых мероприятиях, как День биолога, Geek Picnic и Nauka 0+. Также мы взаимодействовали со школьниками на биошколе "Пилигрим" и посредством лекториев "Перспектива" и BioBoot Camp. В качестве своеобразного итога всех мероприятий участники нашей команды разработали игру по биоинженерии BioLego Go. Она позволяет собирать свои экспериментальные конструкции онлайн.

С уверенностью могу сказать, что iGEM - лучшее событие в 2020 году. На конкурсе я познакомилась с замечательными ребятами, причём как со своими соотечественниками, так и с участниками из-за границы. Мы все вместе стали большой командой и частью сообщества людей, интересующихся биоинженерией и биотехнологиями.

Анастасия Кислова: iGEM стал лучшим событием в моём 2020 году. Всё началось со случайно открытой лекции на Дне биолога и щелчка мыши, подтвердившего отправку заявки на участие, а закончилось... Знаете, трудно подобрать слова. Но ощущение такое, словно я прошла через приключение. А из хорошего приключения невозможно вернуться домой тем же человеком, которым в него когда-то отправился.

Проще говоря, iGEM меняет людей. Меняет в лучшую сторону. Сложно сказать, благодаря чему именно. Возможно, дело в уникальности критериев оценивания проектов. Я не знаю другого конкурса, который мотивировал бы студентов создавать что-то настолько практикоориентированное. Может быть, всё дело в людях, с которыми я попала в одну команду. Или же в iGEM-сообществе, объединённым искренним порывом создать не просто что-то интересное, а сделать мир своими разработками чуточку лучше.

iGEM дал опыт, много опыта, и не только в решении научных задач. И самое главное: iGEM оставил за собой ощущение, что всё было не зря.


Best regards, Boris

--- Ручка шариковая, цена 1.1.5-021027

Uncle Sasha написал(а) к Boris Paleev в Nov 20 10:10:21 по местному времени:

Dear Boris Paleev,

On 27.11.20 you wrote to All:

BP> Триумф России на конкурсе iGEM 2020: эксклюзивное интервью

Опять "триумф"! Россия - родина слонов (зачеркнуто) триумфов. Тем временем
МКС разваливается.

Sincerely yours,
Alex Tihonov


... Как непригляден либерал без макияжа...
--- FoxPro 2.60

Mark Arkanov написал(а) к Uncle Sasha в Nov 20 16:21:38 по местному времени:

Привет, Uncle!

27 Ноя 20 10:10, ты писал(а) Boris Paleev:

US> Опять "триумф"! Россия - родина слонов (зачеркнуто) триумфов. Тем
US> временем МКС разваливается.

Нештатные ситуации были и на Салютах, Алмазах и Мире, регулярно. Такова их специфика. Про Мир сколько было дезы, могла бы и дальше работать, если бы не измена Родине Путиным.

Mark

--- GoldED+/W32-MINGW 1.1.5-b20060703 (New Point Express)

Uncle Sasha написал(а) к Mark Arkanov в Nov 20 08:48:56 по местному времени:

Dear Mark Arkanov,

On 27.11.20 you wrote to Uncle Sasha:


US>> Опять "триумф"! Россия - родина слонов (зачеркнуто) триумфов. Тем
US>> временем МКС разваливается.

MA> Нештатные ситуации были и на Салютах, Алмазах и Мире, регулярно.

Тут процесс (пошел), а не ситуация.

Sincerely yours,
Alex Tihonov


... Выползки из России (Шебаршин)
--- FoxPro 2.60

Mark Arkanov написал(а) к Uncle Sasha в Nov 20 15:26:16 по местному времени:

Привет, Uncle!

28 Ноя 20 08:48, ты писал(а) мне:

MA>> Нештатные ситуации были и на Салютах, Алмазах и Мире, регулярно.

US> Тут процесс (пошел), а не ситуация.

Блоки заменят целиком.

Mark

--- GoldED+/W32-MINGW 1.1.5-b20060703 (New Point Express)

Boris Paleev написал(а) к Uncle Sasha в Nov 20 22:09:34 по местному времени:

Нello Uncle!

Fri Nov 27 2020 10:10, Uncle Sasha wrote to Boris Paleev:

BP>> Триумф России на конкурсе iGEM 2020: эксклюзивное интервью

US> Опять "триумф"! Россия - родина слонов (зачеркнуто) триумфов. Тем временем
US> МКС разваливается.

Различные участки поверхности МКС нагреваются до +150 и охлаждаются до -150 градусов 16 раз в сутки. Сколько это будет за 30 лет - посчитай сам.

И добавь ещё силы инерции, которые изгибают всю конструкцию станции каждый раз, когда приходится изменять её орбиту, чтобы компенсировать трение об остатки атмосферы (газовый хвост Земли) или уклониться от космического мусора (которого всё больше и больше).

Это ещё удивительно, насколько эта станция хорошо держится.

Best regards, Boris

--- Ручка шариковая, цена 1.1.5-021027

Uncle Sasha написал(а) к Mark Arkanov в Nov 20 08:25:22 по местному времени:

Dear Mark Arkanov,

On 28.11.20 you wrote to Uncle Sasha:


MA>>> Нештатные ситуации были и на Салютах, Алмазах и Мире, регулярно.

US>> Тут процесс (пошел), а не ситуация.

MA> Блоки заменят целиком.

Надо всё менять целиком. Не потянем.

Sincerely yours,
Alex Tihonov


... Мнение автора может не совпадать с его позицией.
--- FoxPro 2.60

Uncle Sasha написал(а) к Boris Paleev в Nov 20 08:48:54 по местному времени:

Dear Boris Paleev,

On 28.11.20 you wrote to Uncle Sasha:


BP>>> Триумф России на конкурсе iGEM 2020: эксклюзивное интервью

US>> Опять "триумф"! Россия - родина слонов (зачеркнуто) триумфов. Тем
US>> временем МКС разваливается.

BP> Различные участки поверхности МКС нагреваются до +150 и охлаждаются до
BP> -150 градусов 16 раз в сутки. Сколько это будет за 30 лет - посчитай
BP> сам.

Что она давно уже выработала свой гарантийный срок, я в курсе. Беда в том,
что заменить ее нечем. Резве что рогозинским трамваем.

Sincerely yours,
Alex Tihonov


... Курение - тихий терроризм.
--- FoxPro 2.60

Борис Мордасов написал(а) к Boris Paleev в Nov 20 14:46:14 по местному времени:

Нello, Boris!



BP> Различные участки поверхности МКС нагреваются до +150 и охлаждаются до -150 градусов 16 раз в сутки.

Чего???????



С наилучшими пожеланиями, Борис Мордасов.

--- wfido

Boris Paleev написал(а) к Uncle Sasha в Nov 20 21:41:44 по местному времени:

Нello Uncle!

Sun Nov 29 2020 08:48, Uncle Sasha wrote to Boris Paleev:

BP>>>> Триумф России на конкурсе iGEM 2020: эксклюзивное интервью

US>>> Опять "триумф"! Россия - родина слонов (зачеркнуто) триумфов. Тем
US>>> временем МКС разваливается.

BP>> Различные участки поверхности МКС нагреваются до +150 и охлаждаются до
BP>> -150 градусов 16 раз в сутки. Сколько это будет за 30 лет - посчитай
BP>> сам.

US> Что она давно уже выработала свой гарантийный срок, я в курсе. Беда в том,
US> что заменить ее нечем. Резве что рогозинским трамваем.

Ни пиндосы, ни объединённые европейцы, ни китайцы даже не собираются договариваться друг с другом и планировать следующую МКС на замену этой.

А надо было уже начинать планировать несколько лет назад - от принятия решения о создании МКС до начала создания МКС в своё время прошло 14 лет.

Опять все ждут, когда Россия впряжётся по полной?

Ведь первый проект МКС, который разрабатывался с 1984 года (станция "Фридом"), через несколько лет был сочтён слишком дорогостоящим даже для объединённых усилий США, ЕС, Канады и Японии.

И тут подвернулись русские, у которых как раз рухнуло государство, так что государственная космонавтика осталась без средств к существованию и готова была работать на кого угодно и продать за малый прайс все свои наработки, лишь бы выжить.

И даже после получения неограниченного доступа к российским космическим ресурсам, пиндосы сопротивлялись до последнего, не желая тратить деньги своих налогоплательщиков:

=========== википедия
При этом, в 1993 году в США многие политики были против строительства космической орбитальной станции - в июне 1993 в Конгрессе США обсуждалось предложение об отказе от создания Международной космической станции; это предложение не было принято с перевесом только в один голос: 215 голосов за отказ, 216 голосов за строительство станции.
===========

Best regards, Boris

--- Ручка шариковая, цена 1.1.5-021027